Mit Hilfe von Schnittstellen (engl. Interface, in diesem Zusammenhang API = application programming interface) werden Daten zwischen zwei Systemen ausgetauscht. Somit bildet die Schnittstelle den Übergang zwischen zwei Systemen und gewährleistet den Austausch von Daten. Um den Datenaustausch fehlerfrei durchführen zu können, muss jede Schnittstelle konfiguriert werden. Die Konfiguration unterteilt sich in folgende Bereiche:
In mercaware existieren generische Schnittstellen, die direkt vom Anwender eingerichtet werden können. Alternativ steht aber auch eine RPC-Schnittstelle zur Verfügung.